Генетики разобрались, как очищать ДНК от примесей

Контаминация ДНК

Долгое время перед генетиками стояла трудная дилемма по детерминации чистой ДНК. Названием этой дилеммы являлась контаминация.

Ранее, при работе с достаточно старыми образцами, содержащими в себе чьи либо ДНК, ученым-генетикам приходилось всегда брать в расчет контаминацию. Контаминация представляет собой, по сути, загрязнение ДНК исследуемого материала каким либо посторонним ДНК, либо каким-то веществом. На практике, причинами существования данного явления совершенно спокойно могут стать внедряемые в объект исследования участки ДНК исследователя. Поэтому, обычно, имея дело с образцами клеток древних людей, невозможно было определить, каким же на самом деле было ДНК прародителей современного человека.

В связи с необходимостью решения данной проблемы группа немецких и шведских ученных-генетиков во главе с Понтусом Скоглундом проанализировала данный вопрос с разных сторон. Она пришла к ответу, каким образом можно убрать посторонние элементы из чистой ДНК на примере современного человека и неандертальца.

Как получить чистое ДНК

Суть метода получения чистого ДНК заключается в последовательном исключении объектов загрязнения посредством анализа естественной мутации ДНК.

Учеными было замечено, что практически в половине случаев у исследуемых объектов, возраст которых достигает нескольких тысяч лет, гуанин превращается в аденин, а цитозин в тимин. Разработав модель процессов естественного изменения ДНК с течением времени и сравнивая данную модель с полученными образцами, ученые могут детерминировать исходную белковую цепь.

На основе данных расчетов было проведено исследование ДНК неандертальца из пещеры Окладникова. Результаты анализа ученых были сопоставлены с полученными данными по ДНК неандертальцев из Центральной и Западной Европы. Новые результаты, полученные применением новаторского метода, отобразили различие в геноме неандертальцев различного территориального расположения. Данные различия не свидетельствуют о чем-то необычном, но позволяют определить неандертальцев в различные генетические группы.

Исследователи-генетики имеют новые методы по определению чистой ДНК с объектов древнего мира

Данное открытие позволит совершать новые научные поиски в генетике на более высоком уровне. Научная команда Понтуса Скоглунда на примере останков неандертальца из пещеры Окладникова показала, каким образом метод по выявлению чистой ДНК работает на практике. Из 6096 митохондриальных последовательностей ДНК, детерминируя загрязнение и учитывая их, ученые проанализировали произошедшие процессы естественной мутации, свойственные для неандертальцев, в результате чего было выявлено чуть более 10% загрязнения участка цепи ДНК. В целях повышения четкости анализа ученым пришлось снизить анализируемое число митохондриальных последовательностей ДНК до 3908 штук, что позволило снизить уровень загрязнения на 1,3%.

Стоит отметить, что в целях проверки собственного метода ученые намеренно загрязняли образец ДНК современного человека, изначально зная его исходные значения. На основе собственной модели анализа, исследователи смогли точно устранить загрязнение из ДНК и прийти к верному результату. Данный факт лишний раз свидетельствует о том, что выводы ученых о неандертальцах объективны. Кроме того, однозначно можно сказать, что исследователи находятся на правильном пути, и их мутационная модель получения чистого ДНК из древних органических материалов применима на практике в генетике.