Учеными расшифрован геном карликовой березы

Британские биологи впервые расшифровали и опубликовали полный геном карликовой березы, изучение которого поможет понять, почему эти березы и их "большие" сестры не способны противостоять набегам жуков-узкозлаток, проникших в Европу и Азию из Северной Америки.

Джеймс Борелл из университета Королевы Марии в Лондоне (один из авторов открытия) заявил о том, что полученный геном чрезвычайно ценен.  Он будет добавлен к инструментам, которые уже используются для того чтобы сохранить популяции берез в Британии. Планируется с его помощью оценить генетическое разнообразие среди карликовых берез и подготовить стратегию по их спасению.

Геном карликовой березы был расшифрован группой генетиков из университета Королевы Марии в процессе попыток найти генетические корни эпидемии бронзовых узкозлаток в европейских березовых рощах. Они питаются корой и другими частями деревьев. Раньше эти жуки обитали только на территории Канады и США, но сейчас они проникли в Британию и некоторые другие европейские страны. Березы в данных странах не обладают устойчивостью к узкозлаткам, поэтому это стало фактически экологической катастрофой.

В северных районах Шотландии были собраны образцы клеток березы и извлечен из них генетический материал. Затем геном был расшифрован. Оказалось, что он содержит 450 миллионов нуклеотидов ("букв" ДНК). По своему качеству он не уступает аналогичным последовательностям для человека и других организмов. Прочитан каждый нуклеотид был 67 раз. Это сводит к минимуму число возможных ошибок при секвенировании генома.

Исследователями были выявлены в геноме несколько подозрительных участков, которые могут влиять на способность защиты березы от нападений узкозлаток. Планируется сравнить их с аналогичными фрагментами в геномах 15 других видов берез. Таким образом будет найдена причина уязвимости. В открытой онлайн-библиотеке Dryad виртуальный геном был опубликован.

Изучать генетику берез на карликовых березах очень удобно. Она легко выращивается, имеет небольшие размеры и её геном гораздо меньше, чем у некоторых других видов берез. Для всех ученых, которые исследуют различные виды берез, расшифрованный геном является полезным источником данных.